<rdf:RDF
    xmlns:rdf="http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#"
    xmlns:dc="http://purl.org/dc/elements/1.1/"
    xmlns:ns5="http://metadb.riken.jp/db/SciNetS_rib102i/"
    xmlns:ns1="http://metadb.riken.jp/db/SciNetS_ria227i/"
    xmlns:rdfs="http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#"
    xmlns:ns7="http://metadb.riken.jp/meta/1.0/"
    xmlns:ns9="http://creativecommons.org/ns#"
    xmlns:foaf="http://xmlns.com/foaf/0.1/"
    xmlns:xsd="http://www.w3.org/2001/XMLSchema#"
    xmlns:ns3="http://database.riken.jp/sw/item/">
  <rdf:Description rdf:about="http://metadb.riken.jp/db/SciNetS_ria227i/cria227s8ria227u325653001000i">
    <ns1:pria227s1i>
      <ns1:cria227s2i rdf:about="http://metadb.riken.jp/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria227u325653001000i">
        <rdfs:seeAlso rdf:resource="http://database.riken.jp/sw/item/cria227s2ria227u325653001000i"/>
        <ns7:hasFile rdf:resource="http://metadb.riken.jp/dbfiles/SciNetS_ria227i/cria227s2i/cria227s2ria227u325653001000i/description.html"/>
        <ns1:pria227s43i xml:lang="en">without_OMAT_gene</ns1:pria227s43i>
        <dc:description xml:lang="en">&lt;html&gt;&lt;body&gt;&lt;title&gt;AT3G56530.1&lt;/title&gt;(&amp;uarr; Click "Links", if this line appears at the beginning.)&lt;br&gt;&lt;H1&gt;Other supporting information&lt;/H1&gt;&lt;table&gt;&lt;tr&gt;&lt;td colspan="2" align="left"&gt;&lt;b&gt;Gene Model&lt;/b&gt;&lt;br&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td NOWRAP width="75"&gt;&lt;/td&gt;&lt;td NOWRAP&gt;&lt;img src="/dbfiles/SciNetS_ria227i/cria227s2i/cria227s2ria227u325653001000i/AT3G56530.1.gene_models.png" width="717"&gt;&lt;br&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td colspan=2 align="left"&gt;&lt;b&gt;Correlation Plot&lt;/b&gt;&lt;br&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td NOWRAP colspan="2" align="left"&gt;&lt;img src="/dbfiles/SciNetS_ria227i/cria227s2i/cria227s2ria227u325653001000i/AT3G56530.1.CorrPlot.jpg" width="800"&gt;&lt;br&gt;&lt;br&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;/table&gt;&lt;hr&gt;&lt;b&gt;Expression profile (Values are plotted in Log(2) values.)&lt;/b&gt;&lt;br&gt;&lt;img src="/dbfiles/SciNetS_ria227i/cria227s2i/cria227s2ria227u325653001000i/AT3G56530.1.F0.Expression.png"&gt;&lt;br&gt;&lt;hr&gt;&lt;b&gt;Genes with related expresssion profiles.&lt;/b&gt;&lt;br&gt;&lt;table border=1&gt;&lt;tr&gt;&lt;th colspan=7 align="left"&gt;Positively Correlated Genes&lt;/th&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;th&gt;Gens&lt;/th&gt;&lt;th&gt;PCC&lt;/th&gt;&lt;th&gt;Definition&lt;/th&gt;&lt;th&gt;Overlap gene&lt;/th&gt;&lt;th&gt;Definition&lt;/th&gt;&lt;th&gt;Overlap gene(antisense)&lt;/th&gt;&lt;th&gt;Definition&lt;/th&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u324356301000i"&gt;AT3G43563.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;0.834317&lt;/td&gt;&lt;td&gt;transposable element gene&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u127428001000i"&gt;AT1G74280.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;0.810038&lt;/td&gt;&lt;td&gt;hydrolase, alpha/beta fold family protein&lt;/td&gt;&lt;td&gt;OMAT1P021570&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u520147002000i"&gt;AT5G01470.2&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;0.768348&lt;/td&gt;&lt;td&gt;unknown protein&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u125187001000i"&gt;AT1G51870.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;0.768306&lt;/td&gt;&lt;td&gt;protein kinase family protein&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u126448001000i"&gt;AT1G64480.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;0.768149&lt;/td&gt;&lt;td&gt;CBL8 (CALCINEURIN B-LIKE PROTEIN 8)&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u126996001000i"&gt;AT1G69960.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;0.759923&lt;/td&gt;&lt;td&gt;PP2A (SERINE/THREONINE PROTEIN PHOSPHATASE 2A)&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u320258001000i"&gt;AT3G02580.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;0.757944&lt;/td&gt;&lt;td&gt;STE1 (STEROL 1)&lt;/td&gt;&lt;td&gt;OMAT3P000720&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u522466001000i"&gt;AT5G24660.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;0.754665&lt;/td&gt;&lt;td&gt;LSU2 (RESPONSE TO LOW SULFUR 2)&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u521150001000i"&gt;AT5G11500.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;0.749712&lt;/td&gt;&lt;td&gt;unknown protein&lt;/td&gt;&lt;td&gt;OMAT5P003910&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u124231001000i"&gt;AT1G42310.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;0.746375&lt;/td&gt;&lt;td&gt;transposable element gene&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;th colspan=7 align="left"&gt;Negatively Correlated Genes&lt;/th&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;th&gt;Gens&lt;/th&gt;&lt;th&gt;PCC&lt;/th&gt;&lt;th&gt;Definition&lt;/th&gt;&lt;th&gt;Overlap gene&lt;/th&gt;&lt;th&gt;Definition&lt;/th&gt;&lt;th&gt;Overlap gene(antisense)&lt;/th&gt;&lt;th&gt;Definition&lt;/th&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u326291001000i"&gt;AT3G62910.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-0.793448&lt;/td&gt;&lt;td&gt;APG3 (ALBINO AND PALE GREEN)&lt;/td&gt;&lt;td&gt;OMAT3P115760&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u521752001000i"&gt;AT5G17520.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-0.774959&lt;/td&gt;&lt;td&gt;RCP1 (ROOT CAP 1)&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u222967001000i"&gt;AT2G29670.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-0.774151&lt;/td&gt;&lt;td&gt;binding&lt;/td&gt;&lt;td&gt;OMAT2P106100&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;OMAT2P006870&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u324462001000i"&gt;AT3G44620.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-0.752118&lt;/td&gt;&lt;td&gt;protein tyrosine phosphatase&lt;/td&gt;&lt;td&gt;OMAT3P011535&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u326255001000i"&gt;AT3G62550.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-0.743803&lt;/td&gt;&lt;td&gt;universal stress protein (USP) family protein&lt;/td&gt;&lt;td&gt;OMAT3P017810&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u525045001000i"&gt;AT5G50450.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-0.740471&lt;/td&gt;&lt;td&gt;zinc finger (MYND type) family protein&lt;/td&gt;&lt;td&gt;OMAT5P113040&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u525833001000i"&gt;AT5G58330.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-0.732511&lt;/td&gt;&lt;td&gt;malate dehydrogenase (NADP), chloroplast, putative&lt;/td&gt;&lt;td&gt;OMAT5P115400&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;OMAT5P017620,OMAT5P017630&lt;/td&gt;&lt;td&gt;[OMAT5P017620]-, [OMAT5P017630]-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u522756001000i"&gt;AT5G27560.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-0.730939&lt;/td&gt;&lt;td&gt;unknown protein&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u220470001000i"&gt;AT2G04700.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-0.730732&lt;/td&gt;&lt;td&gt;ferredoxin thioredoxin reductase catalytic beta chain family protein&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u127002001000i"&gt;AT1G70020.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-0.727158&lt;/td&gt;&lt;td&gt;unknown protein&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;/table&gt;&lt;br&gt;&lt;a href="/dbfiles/SciNetS_ria227i/cria227s2i/cria227s2ria227u325653001000i/AT3G56530.1-correlation.txt"&gt;Get whole results&lt;/a&gt;&lt;br&gt;&lt;br&gt; &lt;HR&gt;&lt;b&gt;Over-Representation Analysis Result&lt;/b&gt;&lt;br&gt;&lt;br&gt;&lt;table border="1"&gt;&lt;tr bgcolor=#FF69B4&gt;&lt;td&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;&lt;i&gt;p&lt;/i&gt;-value&lt;/td&gt;&lt;td&gt; &lt;= 1.00e-06&lt;/td&gt;&lt;td&gt;:20 terms with high significance&lt;/td&gt;&lt;/a&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr bgcolor=#FFFACD&gt;&lt;td&gt;1.00e-06 &lt; &lt;/td&gt;&lt;td&gt;&lt;i&gt;p&lt;/i&gt;-value&lt;/td&gt;&lt;td&gt; &lt;= 8.76e-06&lt;/td&gt;&lt;td&gt;                  :With considering multiple testing correction;&lt;br&gt;&lt;i&gt;p&lt;/i&gt; &lt;=  1.00e-02 / 1142&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr bgcolor=#FFFFFF&gt;&lt;td&gt;8.76e-06 &lt; &lt;/td&gt;&lt;td&gt;&lt;i&gt;p&lt;/i&gt;-value&lt;/td&gt;&lt;td&gt; &lt;= 1.00e-02&lt;/td&gt;&lt;td&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;/table&gt;&lt;br&gt;&lt;table border="1"&gt;&lt;tr&gt;&lt;th&gt;Type of term (*1)&lt;/th&gt;&lt;th&gt;Depth of the term in ontology tree&lt;/th&gt;&lt;th&gt;ID/Term&lt;/th&gt;&lt;th&gt;Description&lt;/th&gt;&lt;th&gt;Number of genes&lt;/th&gt;&lt;th&gt;Over-Representative rate (*2)&lt;/th&gt;&lt;th&gt;&lt;i&gt;p&lt;/i&gt;-value (*3)&lt;/th&gt;&lt;th&gt;PosMed &lt;i&gt;p&lt;/i&gt;-value (*4)&lt;br&gt; (Link to PosMed)&lt;/th&gt;&lt;th&gt;Found on gene annotation&lt;/th&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr bgcolor=#FFFFFF&gt;&lt;td&gt;KW&lt;/td&gt;&lt;td&gt;0&lt;/td&gt;&lt;td&gt;stimulus&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;10/200&lt;/td&gt;&lt;td&gt;2.32&lt;/td&gt;&lt;td&gt;4.26e-03&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;no&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr bgcolor=#FFFFFF&gt;&lt;td&gt;KW&lt;/td&gt;&lt;td&gt;0&lt;/td&gt;&lt;td&gt;transmembrane&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;14/200&lt;/td&gt;&lt;td&gt;1.93&lt;/td&gt;&lt;td&gt;6.56e-03&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;no&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr bgcolor=#FFFFFF&gt;&lt;td&gt;KW&lt;/td&gt;&lt;td&gt;0&lt;/td&gt;&lt;td&gt;response&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;28/200&lt;/td&gt;&lt;td&gt;1.56&lt;/td&gt;&lt;td&gt;6.81e-03&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;no&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;/table&gt;&lt;table&gt;&lt;tr&gt;&lt;td valign=top&gt;(*1)&lt;/td&gt;&lt;td&gt;[KW]:words found in gene description.&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td valign=top&gt;(*2)&lt;/td&gt;&lt;td&gt;([# of genes with the term] / [# of sampling (200)]) / ([# of genes with the term among whole genes] / [# of whole genes])          &lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td valign=top&gt;(*3)&lt;/td&gt;&lt;td&gt;P-values were calculated on hypergeometric distribution in which we found &lt;i&gt;n&lt;/i&gt; genes with a annotation term during 200           highly correlated genes, while we had &lt;i&gt;N&lt;/i&gt; genes           with the term in the whole genes.&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td valign=top&gt;(*4)&lt;/td&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="http://omicspace.riken.jp/PosMed-plus/"&gt;PosMed&lt;/a&gt; is a system which serve a p-values showing a relationship           between the gene and the annotation term based on literature information and Gene-Gene interaction suchas co-expression or           protein-protein interactions.&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;/table&gt;&lt;hr&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s904i"&gt;Top Page&lt;/a&gt;&lt;/body&gt;&lt;/html&gt;</dc:description>
        <ns7:hasFile rdf:resource="http://metadb.riken.jp/dbfiles/SciNetS_ria227i/cria227s2i/cria227s2ria227u325653001000i/AT3G56530.1-correlation.txt"/>
        <foaf:depiction rdf:resource="http://metadb.riken.jp/dbfiles/SciNetS_ria227i/cria227s2i/cria227s2ria227u325653001000i/AT3G56530.1.F0.Expression.png"/>
        <foaf:depiction rdf:resource="http://metadb.riken.jp/dbfiles/SciNetS_ria227i/cria227s2i/cria227s2ria227u325653001000i/AT3G56530.1.gene_models.png"/>
        <ns1:pria227s3i rdf:resource="http://metadb.riken.jp/db/SciNetS_rib102i/crib102u0rib102u30000056530i"/>
        <ns1:pria227s6i rdf:resource="http://metadb.riken.jp/db/SciNetS_ria227i/cria227s11ria227u325653001000i"/>
        <ns9:attributionURL rdf:resource="http://matome.base.riken.jp/omat_gene_db/gene_info/gene_info.cgi?id=AT3G56530.1"/>
        <ns7:hasFile rdf:resource="http://metadb.riken.jp/dbfiles/SciNetS_ria227i/cria227s2i/cria227s2ria227u325653001000i/AT3G56530.1.ArrayResult.pdf"/>
        <foaf:depiction rdf:resource="http://metadb.riken.jp/dbfiles/SciNetS_ria227i/cria227s2i/cria227s2ria227u325653001000i/AT3G56530.1.CorrPlot.jpg"/>
        <ns1:pria227s9i rdf:datatype="http://www.w3.org/2001/XMLSchema#decimal"
        >0.46676000000000000822</ns1:pria227s9i>
        <rdfs:label xml:lang="en">AT3G56530.1</rdfs:label>
      </ns1:cria227s2i>
    </ns1:pria227s1i>
  </rdf:Description>
</rdf:RDF>